大腸主要存在的細菌包括：

　　1. 大腸桿菌（Escherichia coli）：是人和動物腸道中最常見的細菌之一，大部分大腸桿菌對人體有益，但也有一些致病菌會引起胃腸道感染。

　　2. 埃希菌（Aeromonas）：一類引起胃腸道感染和食物中毒的細菌，常見于水體中，也可引起皮膚和軟組織感染。

　　3. 梭菌屬（Clostridium）：包括許多致病菌，如產氣莢膜梭菌（Clostridium perfringens）和難辨梭菌（Clostridium difficile），引起食物中毒和腸道感染。

　　4. 厭氧菌：生長在缺氧環境中的細菌，包括雙歧桿菌（Bifidobacterium）和乳酸桿菌（Lactobacillus），這些菌群對人體有益，能夠幫助消化和吸收營養物質。

　　5. 弧菌屬（Vibrio）：包括霍亂弧菌（Vibrio cholerae）、弧菌（Vibrio parahaemolyticus）等致病菌，引起嚴重的胃腸道感染和食物中毒。

　　6. 糞腸球菌（Enterococcus）：一類常見于大腸中的細菌，大多數是人體的共生菌，但某些菌株也可以引起感染。

　　7. 菌群（Bacteroides）：與人體營養消化密切相關的細菌群，參與膳食纖維的分解，產生有益代謝產物。