包涵體蛋白純化步驟如下：

　　1. 破細胞：將含有目的蛋白的細胞在高壓下破碎，使包涵體釋放出來。

　　2. 溶解：將包涵體洗滌后，在強力溶解劑（如尿素）中進行溶解，使目的蛋白從包涵體中釋放出來。

　　3. 層析：將蛋白質混合物加載到柱中，利用不同的化學和物理特性進行分離。常用的層析方法包括離子交換層析、逆相層析、尺寸排除層析等。

　　4. 純化：通過對分離得到的蛋白樣品進行多輪的層析步驟，可以達到高度純化的目的。

　　5. 分析：通過蛋白質電泳、質譜等技術對純化的蛋白質進行分析，確定目標蛋白已經達到純化要求。

　　6. 保存：將純化得到的蛋白質進行凍干或溶液冷凍保存，以供后續實驗使用。