咽部正常菌群包括多種細菌，其中最常見的包括：

　　1. 口腔鏈球菌（Streptococcus mitis/oralis）

　　2. 肺炎鏈球菌（Streptococcus pneumoniae）

　　3. 溶血性鏈球菌（Streptococcus pyogenes）

　　4. 普通葡萄球菌（Staphylococcus aureus）

　　5. 鼻疽桿菌（Corynebacterium diphtheriae）

　　6. 嗜酸乳桿菌（Lactobacillus）

　　7. 草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）

　　8. 厭氧菌（Bacteroides spp.）

　　9. 各種厭氧梭菌（Clostridium spp.）

　　10. 大腸埃希菌（Escherichia coli）

　　11. 假單胞菌（Pseudomonas aeruginosa）

　　12. 內皮單胞菌（Neisseria spp.）

　　這只是一部分，不同人的正常菌群成分也可能存在差異。