腸道菌群與人的免疫系統之間存在著一種共生關系，它們之間互相影響并在某種程度上相互促進。正常情況下，腸道菌群不會引起免疫系統的攻擊，而是與免疫系統一起協同作用，保持身體的健康狀態。一些研究表明，腸道菌群能夠促進免疫系統的發育和功能，同時免疫系統也能夠幫助控制腸道菌群的數量和種類。當腸道菌群失去平衡或者某些細菌進入到其他器官中時，就可能會觸發免疫系統的攻擊，引起炎癥和其他免疫相關疾病。