研究正常微生物群的結構、功能及其與宿主相互依賴和相互制約關系的科學稱為微生態學。

　　自70年代德國漢堡成立第一所微生態學研究所起，微生態學逐漸發展成為一門新興學科而令人矚目。微生態學是生命科學的分支，作為一門研究生物體正常微生物群與其宿主相互依賴、相互制約規律的科學，它涉及生物體與其內環境（包括微生物、生物化學和生物物理環境)相適應的問題，與人類健康密切相關。人類醫學經歷了醫學和預防醫學，正在向保健醫學邁進，微生態學則是保健醫學的理論和實際應用的基礎學科。

　　微生態學是研究正常微生物群與其宿主相互關系的生命科學分支，人體內存在著大量的微生物,僅胃腸道內就寄居著400-500種微生物，這些正常微生物群在人體消化、吸收、營養、免疫等生理活動過程中發揮著巨大的作用，微生態學的發展為我們認識生命和疾病的本質提供了全新的視角，微生態學的一些基本理論觀點與中醫學理論如整體觀念、陰陽學說、邪正盛衰等存在著某些相似之處。也有很多不盡相同之處。認識和了解三個學科的不同點，對以疾病的和預防有重要意義。

　　同一種疾病，用不同的學科來分析，得出的結論是不一樣的。從理論上來看，都有各自的理論依據，但是，用在具體的過程中，得出的結果是不盡相同。所有，每個人的模式偏向就不盡相同。當然，這取決于個人對學科的認知度和學科的普及力度有關。

　　作為中醫來說，對疾病的理解大多集中在陰陽學說；西醫來說主要集中在炎癥或病毒。微生態學則主要集中在菌群環境或微生態環境平衡。

　　微生態學是保健醫學的理論和實際應用的基礎學科。在目前，微生態學的發展落后于前兩類。但是，微生態學在人類的健康中同樣具有重要的地位。微生態制劑有其他藥不可替代的優點，即“患病治病，未病防病，無病保健”的效果。

　　對于我們常用的方式而言，微生態學在對于頑固性、疑難性、長期性的疾病中，他有較多的長處。比如：微生態制劑沒有耐藥性、沒有毒副作用等，這一新型、發展中的學科在現在，乃至將來越來越受到現代人的關注和信賴。