菌群失調可以分為以下三類：

　　1. 細菌群失調：細菌群失衡是腸道菌群失調的最常見形式，不良的飲食習慣和使用抗生素等原因導致良性細菌數量減少，病原細菌數量增加，從而影響腸道微生態平衡。

　　2. 酵母菌失調：酵母菌群失調也是腸道菌群失調的一種形式。酵母菌是一種單細胞真菌，當其數量過多時可能引發感染和疾病。

　　3. 真菌群失調：真菌群失調指腸道微生物群落中真菌的種類和數量失控，引發炎癥和疾病。真菌常常生長在腸道內，但過多的真菌會影響腸道正常功能。常見的真菌有酵母菌、霉菌等。