菌蛋白（Fungal protein）是指由真菌合成的蛋白質。真菌是一類生物體，常見的包括酵母菌、霉菌等。真菌是一類重要的微生物資源，其合成的蛋白質具有廣泛的應用價值，如食品工業中的酶、抗氧化劑、增稠劑等；醫藥領域中的抗菌藥物、生物制劑、免疫調節劑等。近年來，隨著生物技術的不斷發展，利用真菌生產菌蛋白已成為一種重要的生物制造技術。