主要生化菌種有以下幾種：

　　1. 好氧菌：好氧菌是指在有氧條件下進行代謝活動的微生物。主要代表為需氧菌和好氧呼吸菌。需氧菌能夠利用污水中的有機物質和氧氣進行生長和代謝，從而將有機物質降解為無機物質。好氧呼吸菌通過氧化有機物質和氧氣產生能量，并將有機物質降解為二氧化碳和水。

　　2. 嫌氧菌：嫌氧菌是指在缺氧或微氧條件下進行代謝活動的微生物。主要代表為厭氧消化菌和厭氧呼吸菌。厭氧消化菌能夠利用有機物質進行生長和代謝，將有機物質轉化為甲烷和二氧化碳等產物。厭氧呼吸菌通過在缺氧條件下進行呼吸作用，將有機物質降解為二氧化碳和水。

　　以上是污水處理主要生化菌種的幾個代表，具體的菌種種類還受到不同環境和處理工藝的影響。