腸道菌群中的一些有害菌包括：

　　1. 大腸埃希氏菌（Escherichia coli）：某些菌株可引起食物中毒。

　　2. 屎腸球菌（Staphylococcus aureus）：可引起皮膚炎、食物中毒等感染。

　　3. 鮑曼不動桿菌（Burkholderia cepacia）：對免疫系統較弱的人造成感染的風險較高，尤其是囊性纖維化患者。

　　4. 沙門氏菌（Salmonella）：可引起食物中毒，導致腹瀉、發熱等癥狀。

　　5. 福氏志賀菌（Shigella）：可引起細菌性痢疾，導致腹瀉、腹痛、發熱等癥狀。

　　6. 銅綠假單胞菌（Pseudomonas aeruginosa）：常導致醫療相關感染，尤其是在免疫系統較弱的患者中。

　　7. 耐藥金黃色葡萄球菌（Methicillin-resistant Staphylococcus aureus，簡稱MRSA）：對多種抗生素產生耐藥性，可引起嚴重的感染。

　　腸道菌群中的有害菌只是其中一部分，大多數情況下，腸道菌群中的細菌對人體是有益的。