如果蛋白表達過程中出現了包涵體，可以考慮以下方法：

　　1. 改變菌株和表達條件：有些菌株對特定蛋白表達的效率更高，調整不同的表達條件也可能會有改善。

　　2. 優化表達載體：可能需要更換表達載體，或者更改啟動子、終止子、標簽等。

　　3. 優化培養條件：包涵體可能是因為培養條件不適宜，調整溫度、震蕩速度、添加輔助物質等。

　　4. 重構蛋白結構：如果表達的蛋白結構對形成包涵體有影響，可以考慮重構蛋白的結構來解決問題。

　　5. 使用親和純化技術：對包涵體進行親和純化，將純化后的蛋白進行折疊重構，還原其活性。

　　這些方法可能需要根據實際情況進行綜合考慮，找到最適合的解決方案。